在上海辦理二類醫療器械經營備案，需要準備一些必要的資料。以下是詳細的辦理流程以及所需的材料清單。

一、辦理流程：

1. 填寫《二類醫療器械經營備案申請表》，并加蓋公章。

2. 提供公司的注冊證書、稅務登記證、組織機構代碼證等相關企業營業執照復印件。

3. 提供公司法定代表人身份證、經辦人身份證復印件。

4. 提供經營場所租賃合同及租賃登記證明。

5. 提供經營范圍涉及的產品（醫療器械）的相關資質證明、產品注冊證書等。

6. 提供與制造商的經銷合同和授權書。

7. 提供相關的質量管理體系文件、質量管理人員的資質證明等。

8. 提交上述材料后，經上海市藥品監督管理局進行審核，審核通過后將辦理備案手續。

二、所需材料清單：

1. 《二類醫療器械經營備案申請表》。

2. 公司的注冊證書、稅務登記證、組織機構代碼證等相關企業營業執照復印件。

3. 公司法定代表人身份證、經辦人身份證復印件。

4. 經營場所租賃合同及租賃登記證明。

5. 經營范圍涉及的產品（醫療器械）的相關資質證明、產品注冊證書等。

6. 與制造商的經銷合同和授權書。

7. 相關的質量管理體系文件、質量管理人員的資質證明等。

辦理二類醫療器械經營備案需要填寫申請表并準備相關企業及個人的營業執照、身份證件，還需提供產品資質證明、租賃合同等材料。經過上海市藥品監督管理局的審核后，即可辦理備案手續。